通過冷卻水塔進行熱交換的水冷式空調系統，散熱效能較氣冷式系統為優秀，節省達20%的用電量。

現時浸大校園內有兩組水冷式空調系統，分別位於善衡校園及浸會大學道校園的教學及行政大樓。